일본 연말정산(확정신고)이 필요한 경우와 대상자 정리 (2026년 최신)

작성일: 2026년 2월 5일 | 최종 수정: 2026년 2월 5일

들어가며

일본에서 일하면 연말에 세금을 정산하는 절차를 거쳐야 합니다. 대부분의 회사원은 회사에서 연말정산을 해주지만, 일부는 본인이 직접 확정신고를 해야 합니다. 연말정산과 확정신고를 제대로 하지 않으면 과다 납부한 세금을 돌려받지 못하거나, 추가 세금을 내야 할 수도 있습니다. 이 글에서는 연말정산과 확정신고의 차이, 누가 어떤 절차를 밟아야 하는지, 그리고 구체적인 방법까지 초보자도 이해할 수 있도록 정리했습니다.

연말정산과 확정신고의 차이

구분	年末調整 (연말정산)	確定申告 (확정신고)
대상	회사원 (급여 소득자)	자영업자, 프리랜서, 특정 회사원
처리 주체	회사	본인
시기	12월	다음 해 2월 16일~3월 15일
대상 세금	소득세만	소득세 + 주민세 기초 자료
정산 방법	회사가 자동 처리	세무서 제출 또는 e-Tax

연말정산 (年末調整)

연말정산이란?

회사가 근로자를 대신하여 1년간의 소득세를 정확히 계산하고 과부족을 정산하는 절차입니다.

연말정산 대상자

12월 31일 시점에 재직 중인 정규직·계약직
연 급여 2,000만 엔 이하
1곳에서만 급여를 받는 사람

연말정산 절차

11월 중순~하순

회사에서 다음 서류를 배포합니다:

扶養控除等申告書 (부양공제 등 신고서)
保険料控除申告書 (보험료 공제 신고서)
基礎控除申告書 (기초공제 신고서)

11월 말~12월 초

근로자가 서류를 작성하여 회사에 제출합니다.

필요한 증명서

생명보험료 납부 증명서
지진보험료 납부 증명서
주택대출 잔고 증명서 (주택차입금 특별공제)
부양가족의 소득 증명 (해당자)

12월 급여 지급 시

회사가 연간 소득세를 정확히 계산하여 정산합니다.

환급: 원천징수액이 많았으면 12월 급여에 추가 지급
추가 징수: 원천징수액이 적었으면 12월 급여에서 차감

1월

회사가 源泉徴収票 (원천징수 영수증)을 교부합니다.

연간 급여 총액
원천징수세액
각종 공제 내역

연말정산에서 받을 수 있는 주요 공제

1. 生命保険料控除 (생명보험료 공제)

생명보험, 의료보험, 개인연금 납부액
최대 12만 엔 공제

2. 地震保険料控除 (지진보험료 공제)

지진보험 납부액
최대 5만 엔 공제

3. 住宅借入金等特別控除 (주택차입금 특별공제)

주택 구입 시 대출이 있는 경우
최대 연 21만~35만 엔 공제 (조건에 따라)
첫 해는 확정신고 필요, 2년차부터 연말정산 가능

4. 扶養控除 (부양공제)

부양가족 1명당 38~63만 엔 공제

5. 配偶者控除 (배우자 공제)

배우자 연 소득 48만 엔 이하
최대 38만 엔 공제

확정신고 (確定申告)

확정신고란?

전년도(1월 1일~12월 31일) 소득을 본인이 직접 신고하고 세금을 정산하는 절차입니다.

확정신고 시기

매년 2월 16일~3월 15일

대상 연도: 전년도 (2026년 2~3월에 2025년 소득 신고)

확정신고가 필수인 경우

1. 급여 소득이 2,000만 엔 초과

고소득자는 회사 연말정산 불가

2. 2곳 이상에서 급여 받음

본업 + 부업
이직하여 2곳 이상에서 급여 받음
부업 급여가 20만 엔 초과

3. 급여 외 소득이 20만 엔 초과

부업 소득
부동산 소득
주식 양도 소득 (특정 계좌 제외)
암호화폐 소득

4. 중도 퇴사 후 재취업 안 함

연말에 재직 중이 아니면 회사 연말정산 불가

5. 자영업자, 프리랜서

사업소득이 있는 경우 의무

확정신고를 하면 유리한 경우 (선택)

1. 医療費控除 (의료비 공제)

연간 의료비가 10만 엔 초과
초과분을 소득에서 공제 (최대 200만 엔)
가족 합산 가능

2. 寄附金控除 (기부금 공제)

후루사토 납세 (ふるさと納税)
기부금 - 2,000엔 = 공제액
와원스톱 특례 신청 안 한 경우

3. 住宅ローン控除 1년차

주택 구입 첫 해는 확정신고 필수

4. 중도 퇴사 후 소득 감소

원천징수세액이 과다한 경우 환급

5. 株式譲渡損失 (주식 양도 손실)

손실을 이월하여 다음 해 이익과 상쇄

확정신고 방법

방법 1: e-Tax (온라인)

국세청 e-Tax 사이트
마이넘버 카드 + 카드 리더기 필요
24시간 신청 가능
우대: 청색신고 특별공제 65만 엔 (사업자)

방법 2: 세무서 방문

관할 세무서 방문
서류 작성 후 제출
상담 가능

방법 3: 우편 제출

확정신고서 작성 후 우편 발송
기한 내 소인 유효

확정신고 필요 서류

공통 서류

확정신고서 (申告書)
원천징수 영수증 (源泉徴収票)
마이넘버 카드 또는 통지 카드 + 신분증
은행 계좌 정보 (환급받을 계좌)

추가 서류 (해당자)

의료비 명세서
기부금 영수증
주택대출 잔고 증명서
사업 장부 (자영업자)

외국인 특별 사항

귀국 시 확정신고

연도 중 귀국하는 경우

출국 전에 확정신고를 해야 합니다.

준비할 것

출국일까지의 급여 내역
원천징수 영수증
귀국 항공권 (출국일 증명)

방법

출국 전 세무서 방문
또는 納税管理人 (납세관리인) 지정하여 출국 후 처리

연금 탈퇴일시금 신청

귀국 후 6개월 이상 경과 시 신청 가능

납부한 연금의 일부 환급
확정신고와는 별도 절차

확정신고 실제 사례

사례 1: 중도 퇴사 후 재취업 안 함

상황

2025년 9월 퇴사
연말까지 재취업 안 함
9월까지 급여 총액: 300만 엔
원천징수세액: 12만 엔

확정신고 결과

실제 소득세를 재계산하면 약 8만 엔만 내면 되므로, 4만 엔 환급

사례 2: 의료비 공제

상황

연 급여: 400만 엔
연간 의료비: 25만 엔
보험 적용 후 본인 부담: 25만 엔

공제 가능 금액

25만 엔 - 10만 엔 = 15만 엔 공제
절세 효과: 15만 엔 × 5% (소득세율) = 약 7,500엔 환급

사례 3: 후루사토 납세

상황

연 급여: 400만 엔
후루사토 납세: 3만 엔
와원스톱 특례 미신청

공제 가능 금액

3만 엔 - 2,000엔 = 28,000엔 공제
소득세 환급 + 다음 해 주민세 감액

실제로 많이 헷갈리는 부분

Q1. 회사에서 연말정산을 했는데 확정신고도 해야 하나요?

회사 연말정산만으로 충분합니다. 단, 의료비 공제나 기부금 공제를 추가로 받고 싶으면 확정신고를 할 수 있습니다.

Q2. 확정신고를 안 하면 어떻게 되나요?

의무 대상자가 안 하면 무신고 가산세(15~20%)가 부과됩니다. 환급 대상자가 안 하면 환급을 못 받을 뿐입니다.

Q3. 기한을 넘기면 어떻게 되나요?

3월 15일 이후에도 신고는 가능하지만, 기한 후 신고로 간주되어 청색신고 특별공제 등 혜택이 줄어들 수 있습니다.

Q4. 환급은 언제 받나요?

e-Tax: 약 2~3주 후 / 우편·방문: 약 1~2개월 후

Q5. 외국인도 후루사토 납세를 할 수 있나요?

네, 일본에서 주민세를 납부하는 사람이라면 누구나 가능합니다.

확정신고 체크리스트

신고 전 확인

□ 원천징수 영수증 준비
□ 의료비 영수증 정리 (해당자)
□ 기부금 영수증 준비 (해당자)
□ 마이넘버 확인
□ 환급받을 은행 계좌 확인

제출 후

□ 환급 시기 확인
□ 주민세 결정 통지서 확인 (6월)

핵심 정리

연말정산은 회사가 처리, 확정신고는 본인이 직접
급여 2,000만 엔 초과, 2곳 이상 근무 시 확정신고 필수
의료비 공제, 기부금 공제는 확정신고로만 가능
확정신고 시기는 매년 2월 16일~3월 15일
e-Tax 이용 시 환급이 빠름

참고 자료

이 글은 일본 국세청 공식 자료를 바탕으로 작성되었습니다.

일본 국세청: https://www.nta.go.jp
e-Tax: https://www.e-tax.nta.go.jp

작성자 소개

이 글은 일본에서 연말정산과 확정신고를 직접 경험한 내용을 바탕으로 작성되었습니다.